最全面人类基因突变分子效应图谱发布

据报道，谷歌旗下深度思维公司8日发布了人类基因组图谱——阿尔法基因组Atlas。该图谱覆盖了人类基因组中约90亿种单核苷酸变异（单个DNA字母改变）可能导致的潜在影响，是迄今最全面的基因突变分子效应目录。它不仅有助于筛选致病突变，更能在罕见病研究中发现被忽视的关键变异，为精准医疗开辟新途径。

人类基因组由30多亿个碱基组成。图片来源：《自然》网站

DNA包含4种字母：A、T、C、G，分别代表腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤，统称为碱基。人类基因组含有30多亿个碱基，其中只有约2%直接编码蛋白质，其余部分多是调控序列或功能尚未完全明确的区域。

基因组中最常见的变异之一，是这4种字母之一的改变。正是这类单字母变化，造就了人与人之间的差异，也带来了不同的疾病风险。

阿尔法基因组Atlas计算了人类基因组中每个DNA字母3种可能核苷酸变化的预测值，数据量高达1拍字节，相当于约2亿张照片。

公司研究团队还开发了预测基因突变生物学影响的指标——阿尔法基因组变异影响（AVI）评分，能可靠地从临床基因组学数据库中识别致病突变。例如，借助AVI评分及其他预测结果，美国博德研究所团队锁定了一个非编码变异，将其认定为一名严重癫痫患者的可能病因。

英国埃克塞特大学统计遗传学家加雷斯·霍克斯表示，该图谱有助于在庞大的全基因组与健康数据库中，揭示“非编码”DNA变异与生物性状及疾病之间的关联。他利用这些预测结果，在英国生物银行5.4万名参与者的全基因组数据中，识别并解释了与数千种血液蛋白水平相关的罕见非编码变异。他还计划将类似分析拓展至身高等其他性状。

英国威康桑格研究所分子生物学家本·莱纳尔认为，该图谱十分有用，但像阿尔法基因组这样的模型，其预测性能还远未达到理想水平，目前不应单独用于临床决策。