新分析方法解码猪基因表达调控密码

近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队开发了一套家畜全基因组等位基因特异性表达分析新方法，解码猪基因表达调控密码，相关研究成果发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。

猪的偏心密码。中国农科院供图

每个生物的细胞里都有两份基因“说明书”，一份来自父亲，一份来自母亲。通常细胞会“公平”地同时阅读两份，但有时会“偏心”只读一份，让另一份“沉睡”。该现象与猪的生长、产肉、繁殖等性状密切相关，但此前缺乏系统研究。

团队分析了公共数据库中6020份猪转录组数据，覆盖34个品种、42种组织。发现猪基因组中存在超30万个等位基因特异性表达位点，且不同组织、不同品种间差异显著。西方瘦肉型猪集中在生长和产肉相关基因，中国地方猪集中在脂肪沉积和繁殖相关基因。目前，相关数据和方法已经完整开源，为猪精准育种和功能基因组学研究提供数据支撑和新工具。

该研究得到深圳市杰出科技创新人才培养计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金、广西自然科学基金等项目支持。